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De nouvelles recherches révèlent les mécanismes à l’origine des débordements d’agents pathogènes et un moyen de les prévoir et de les prévenir.

La préservation et la restauration des habitats naturels pourraient aider à prévenir la propagation des agents pathogènes de la faune aux animaux domestiques et aux humains, selon de nouvelles recherches en Australie. Une étude publiée dans la revue La natureont constaté que lorsque les chauves-souris subissent une perte d’habitat et des pénuries de nourriture, leurs populations peuvent se diviser et excréter davantage de virus.

En conséquence, ils peuvent se rapprocher des humains dans les zones urbaines et agricoles. En analysant les données sur le comportement, la distribution, la reproduction et la disponibilité de la nourriture des chauves-souris, ainsi que les enregistrements du climat, de la perte d’habitat et d’autres conditions environnementales, l’étude a pu prédire quand le virus Hendra, une maladie potentiellement mortelle pour l’homme, se propagerait. des chauves-souris frugivores aux chevaux, puis aux humains.


Les chercheurs ont découvert que les années où la nourriture était abondante dans leurs habitats naturels pendant les mois d’hiver, les chauves-souris vidaient les zones agricoles pour se nourrir dans les forêts indigènes et loin des communautés humaines.

Un deuxième article a été publié en Lettres d’écologie et utilisé les données du La nature étude pour révéler les conditions écologiques lorsque les chauves-souris excrètent plus ou moins de virus.

Alors que des recherches antérieures ont montré des corrélations entre la perte d’habitat et la survenue de débordements d’agents pathogènes, ces études révèlent ensemble pour la première fois un mécanisme pour de tels événements et fournissent une méthode pour les prévoir et les prévenir.


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SRAS-CoV-2

Le coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère (SRAS-CoV-2) est le nom officiel de la souche virale qui cause la maladie à coronavirus (COVID-19). Avant que ce nom ne soit adopté, il était communément appelé le nouveau coronavirus 2019 (2019-nCoV), le coronavirus de Wuhan ou le virus de Wuhan.

” data-gt-translate-attributes=”[{“attribute”:”data-cmtooltip”, “format”:”html”}]”>SARS-CoV-2, SARS-CoV-1, Nipah, Hendra et peut-être Ebola sont tous des exemples de virus qui se propagent mortellement des chauves-souris aux humains, parfois après transmission via un hôte intermédiaire. Chez l’homme, le virus Hendra a un taux de mortalité de 57% et le virus Nipah peut être mortel jusqu’à 100% – bien que la transmission chez l’homme soit inefficace.

« En ce moment, le monde se concentre sur la façon dont nous pouvons arrêter la prochaine pandémie », a déclaré Raina Plowright, professeur au Département de santé publique et des écosystèmes à L’Université de Cornell, et auteur principal des deux études. « Malheureusement, la préservation ou la restauration de la nature fait rarement partie des discussions. Nous espérons que ce document placera la prévention et les solutions basées sur la nature au premier plan de la conversation.

Plowright et ses collègues étudient si les mécanismes de base trouvés dans cette étude s’appliquent à d’autres exemples de propagation d’agents pathogènes de la faune aux humains.

Pour les études, les chercheurs ont développé des ensembles de données de 1996 à 2020 dans l’Australie subtropicale qui décrivaient les emplacements et la taille des populations de chauves-souris frugivores, les paysages où elles se nourrissaient, le climat et les événements El Niño, les années de pénurie alimentaire, les taux de reproduction des chauves-souris, les records des apports de chauves-souris dans les installations de réhabilitation, la perte d’habitat dans les forêts qui fournissent du nectar en hiver et les années de floraison dans les forêts d’hiver existantes.


Les scientifiques ont ensuite créé des modèles informatiques (appelés modèles de réseau bayésien) pour analyser les données, et ils ont découvert deux facteurs entraînant des retombées : la perte d’habitat poussant les animaux vers les zones agricoles et les pénuries alimentaires induites par le climat. Dans les années qui ont suivi un événement El Niño (températures élevées dans l’océan Pacifique), les bourgeons des arbres dont les chauves-souris dépendent pour le nectar n’ont pas produit de fleurs l’hiver suivant, entraînant une pénurie alimentaire. La destruction humaine de l’habitat forestier pour les terres agricoles et le développement urbain a laissé peu de forêts qui produisent du nectar pour les chauves-souris en hiver.

En raison de la pénurie de nourriture, de grandes populations de chauves-souris se sont divisées en petits groupes et se sont déplacées vers les zones agricoles et urbaines, où les espèces de mauvaises herbes et les figuiers, les manguiers et les arbres d’ombrage offraient un abri et des sources de nourriture fiables mais moins nutritives que le nectar.

Lorsqu’elles sont stressées par le manque de nourriture, peu de chauves-souris réussissent à élever leurs petits. Selon le Lettres d’écologie papier, ils excrétent également des virus, peut-être parce qu’ils avaient besoin de conserver l’énergie en l’éloignant de leur système immunitaire. De plus, les chauves-souris qui s’étaient déplacées vers de nouveaux habitats d’hiver, comme les zones agricoles, ont répandu plus de virus que les chauves-souris dans les habitats d’hiver traditionnels.

Dans les zones agricoles, les agents pathogènes peuvent se propager lorsque l’urine et les matières fécales tombent sur le sol où les chevaux paissent, entraînant des infections par le virus Hendra. Les chevaux agissent comme intermédiaires et transmettent occasionnellement le virus aux humains.


À leur grande surprise, Plowright et ses collègues ont découvert que lorsque les peuplements restants d’eucalyptus fleurissaient en hiver, un grand nombre de chauves-souris affluaient vers ces zones. Au cours de ces événements de floraison, la propagation du pathogène a complètement cessé.

« Nous avons mis ces données dans les modèles de réseau et avons constaté que nous pouvions prédire les clusters de débordement en fonction du climat, de la disponibilité de la nourriture et de l’emplacement des chauves-souris », a déclaré Plowright. « Nous montrons que lorsque l’habitat restant produit de la nourriture, les débordements s’arrêtent, et donc un moyen durable d’arrêter ces événements pourrait être de préserver et de restaurer l’habitat essentiel. »

Depuis 2003, les chercheurs ont remarqué une diminution progressive des grands gîtes nomades au profit de nombreux gîtes plus petits dans les zones agricoles et urbaines, une multiplication par cinq sur la période d’étude. Les chauves-souris reviennent moins fréquemment en grand nombre dans leurs habitats naturels qui se rétrécissent. Cela pourrait être dû au fait que les forêts qui fournissent du nectar en hiver ont été largement défrichées.

Références : « Spillover de pathogènes entraîné par des changements rapides dans l’écologie des chauves-souris » par Peggy Eby, Alison J. Peel, Andrew Hoegh, Wyatt Madden, John R. Giles, Peter J. Hudson et Raina K. Plowright, 16 novembre 2022, La nature.
DOI : 10.1038/s41586-022-05506-2



« Les conditions écologiques prédisent l’intensité de l’excrétion du virus Hendra dans l’espace et dans le temps à partir des hôtes réservoirs de chauves-souris » par Daniel J. Becker, Peggy Eby, Wyatt Madden, Alison J. Peel et Raina K. Plowright, 30 octobre 2022, Lettres d’écologie.
DOI : 10.1111/ele.14007

Peggy Eby, écologiste des chauves-souris à l’Université de Nouvelle-Galles du Sud, en Australie, est la première auteure de l’article de Nature. Les co-auteurs incluent Alison Peel, écologiste des maladies de la faune à l’Université Griffith dans le Queensland, en Australie, et Andrew Hoegh, statisticien à l’Université d’État du Montana. Pour l’article Ecology Letters, Daniel Becker, biologiste à l’Université de l’Oklahoma et ancien chercheur postdoctoral à l’Université d’État du Montana, est le premier auteur. Eby et Peel sont également co-auteurs.